@silivriserdar ;
Öncelikle Toolkit kullanmanıza gerek yok.
https://www.maxicep.com/forum/konu/nexus-5-stock-rom-nasil-flashlanir.895330/
Üstteki linkteki konuda anlattığım gibi yapabilirsiniz ama fark etmez, istediğiniz gibi yapın ama her şekilde Stock Rom flashlarken Bootloader kilidi açık olmalı.
Stock KK flashlarken sorun olmaması gerekir. Tekrar denerseniz yüklersiniz.
Android 5.0, 5.1.1'den daha iyi değil. KK yükleyeceğim derseniz anlarım ama 5.1.1'in Lollipop'un en bugsız sürümü. Bence o mesaj attığınız konudaki romu da(Chroma) yükleyebilirsiniz. Yine bootloader açıp, TWRP yükleyeceksiniz.
Açıkçası IMEI olayı ile ilgili çok bir bilgim yok. Ama isterseniz şu konuya bakın:
https://www.maxicep.com/forum/konu/nexus-5-efs-yedegi.910201/ Bulunduğunuz android sürümüne göre zipi indirip yedek alıp, sonra tekrar flashlayabilirsiniz.