Programların kullandığı sesler ".wav, .mid" v.b mp3 dışındaki formatlar oluyor genellikle.
Kullandığın program geniş bir uzantı yelpazesini (yani değişik müzik formatlarını) destekliyorsa, telefondaki müzikleri tararken onları da buluyor olmalı.
Pek sanmıyorum ama programın ayarları içinde, o programla açılacak ses formatlarını sınırlayabiliyorsan (örneğin sadece mp3'leri açsın gibi...) öyle yapabilirsin belki.
Eğer sadece mp3 formatını çalıyor ve bahsettiğin program sesleri dahil, müziklerin hepsi mp3 olduğu için onları da listede görüyorsa,
sadece gösterdiğin klasördeki mp3'leri çalacak başka bir program kullanmanı öneririm.